这种空调系统热源和冷源集中，对空气的基本参数的调整易于实现，它处理空气量大，也便于净化参数控制，运行可靠，是目前大型集群式净化实验室的选择方式。分散式洁净室空调系统大多局限于局部实验室需要净化处理的情况，把单独的空调处理系统安置在净化实验室或净化实验室的不同区域，在出风口通过各类过滤器和净化装置如风机过滤单元(FFU)对空气进行净化处理，每一个末端处理系统可以单独对空气参数进行调节，也可以实现对不同净化实验室净化等级的控制。
在洁净实验室建筑的设计中，必须确保净化室干净易清洁，防止内部和外部污染，防止微粒产生的滞留和积累。使用性能可靠的净化室的建筑设计，确保施工设备的安全运行，并在发生故障时确保人员和财产的安全。主结构应具备洁净室的技术和设备水平、建筑处理和转世水平、净化设备的耐用性和耐火性，装饰应与设备水平相协调，以使其长期发挥作用。能够适应未来变化的设施应能灵活地清理厂房的建筑平面和空间布局，并为生产过程的调整创造条件。主体结构应采用大空间大跨度柱网，不应采用内墙承重体系。这样，就可以在不增加面积和高度的情况下调整工艺和生产设备。
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