在洁净实验室的平面和空间设计中，应对洁净试验区和人员净化、设备和材料净化等辅助室进行划分和布置。同时，应考虑各种技术设施的综合协调效果，如试验操作、工艺设备的安装和维护、送风方式、管道布置和净化空调系统等。实验室内各种固定技术设施(如风口、照明器、回风口、管道等)的布置。)应首先考虑净化空调系统的要求。洁净室空气清洁度等级的检查应根据在动态条件下测试的粉尘颗粒的数量进行。在空气洁净度为5级的洁净室中，应进行多次取样，以计算大于或等于5微米的尘埃颗粒。"当它多次出现时，测试值只能被认为是可靠的。在确定洁净实验室空气洁净度等级时，必须在实验内容、实验仪器和设备上满足空气洁净度的要求，并根据实验操作步骤和实验方案的布置，考虑各实验区不同的净化等级要求，以满足净化要求，节约成本。
洁净实验室中，机械仪器设备洁净室和一般生物洁净室都是采用正压维持, 但对于使用有害气体或使用易燃易爆溶剂以及其他有特殊要求的洁净实验室则采用负压控制。 洁净实验室维持一定的正压是保证洁净室不受或少受污染、是维持设计洁净度等级必不可少地条件之一。即便是负压洁净室，它也必须有不低于它洁净度级别地相邻房间或套间维持一定的正压，负压洁净室的洁净度才能得以维持。 洁净室正压值是指门窗全部关闭状态下，室内静压大于室外静压的数值。它是通过净化系统送风量大于回风量和排风量的方法来达到。不同等级的洁净实验室以及实验室内洁净区与非洁净区之间的静压差，应不小于5Pa，洁净区与室外的静压差，应不小于10 Pa.。 此外，洁净实验室对于风量，风速等各项指标的技术要求也都非常严格，因此，空调系统必须能够满足对其参数进行精确的控制。
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