由于具有不同的等级要求，洁净实验室的建设根据百级、万级、十万级等对应着不同的建设标准。通常来说，为达到洁净等级，主要通过工艺布置、建筑平面、建筑构造与装修、空气洁净措施、人员和物料净化、维护管理等渠道来实现。医院手术室净化工程或医疗洁净室，对空气洁净度要求很高。特殊的建筑区域，如隔离室、特定的测试和护理区域还需要使用高效过滤器对空气进行过滤处理。手术室顶部一般采用有效空气过滤系统，覆盖面积达3×3m以上。
应了解洁净实验室在设计时的各种产品生产工艺的技术特点、工厂建设的技术要求和产品生产过程的特点，并研究净化室的微污染控制机制以及污染物的生产、保留和积累过程，这将涉及物理、化学和生物科学。净化室的空气净化技术、水、气、化学品的净化技术、各种高纯度介质的储运技术，所涉及的技术科学也非常普遍；净化室的防微冲击、噪声控制、防静电、方形电磁波干扰都涉及多种科学，以解决洁净实验室工程设计中的各种具体技术问题。
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