随着对洁净实验室洁净度要求的不断提高，还需要用到超高效过滤器, 那么要求空气处理机组也至少要配置初效、中效、亚高效过滤器系统, 这样对机组的强度要求更高, 对空气处理机组送风机的压头会更大，而对于生物洁净实验室，含菌量也是主要控制参数之一，在空气净化处理方法上一般应增加过滤器，不仅可以有效的滤去空气中的尘埃，也可以阻断细菌和病菌在空调系统中传播和扩散，特别是高效过滤器，对于大气中浮游的病菌、细菌的捕捉效率实际上能达到标准，也可采用有效防止过滤器细菌滋生的过滤器。如含抗菌剂INTESEPT的过滤器、二氧化钛过滤器等，过滤器要定期更换。
使用洁净实验室应该注意的事项：与工作无关或未经批准的人员不得任意进入洁净区，无菌室只能进2人，进入洁净区的人员，其裸露的面部不允许使用化妆品，不得佩戴装饰品，不得留长指甲。不允许任何患感冒、枯草热、皮疹者进入该区室。 操作之前必须已经清洁和消毒，并至少提前30min开超净工作台等净化系统，必要时可开启空调(温度18～26℃，相对湿度30～70％)。凡进入操作间的操作人员不得再外出取物品，因此在每次试验中所用的物品必须计划好，并准备好备用物品，但不得存放任何无关的用品。 在操作间操作时，须点燃酒精灯，使操作在酒精灯火焰旁进行，每次加入或吸取溶液时容器瓶口应通过酒精灯外焰。定期测试无菌室的沉降菌、尘埃粒子。 每次擦洗后的抹布用洗衣皂及自来水清洗干净，于消毒液中浸泡30分钟。
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