洁净实验室之所以洁净，是因为首先使用特殊的工艺阻隔空气与使用空间的自由交流，然后借助于人工的方式把空气处理之后输送到使用空间，当然这里既要输送新风也要输送浊风，所谓浊风就是把使用空间内的空气输送给外界经过处理后使之成为洁净的空气重新输送回使用空间。 其原理可以用下面的流程图来简示：空气气流→初效空气处理→空调→中效空气处理→风机送风→净化管道→高效送风口→洁净室→带走尘埃→回风夹道→新风、初效空气处理。 用于洁净实验室的空调通风系统主要由空气处理设备、粗高中效过滤器、空气输送设施和局部净化设备组成，这些设备类型各异、作用不同。空气处理设备一般是由空调器(AHU)、新风机组(MAU)和循环机组(RAU)组成的一整套机组，是空调净化系统常用的空气热湿交换和空气净化处理设备。
洁净实验室设计气源时有两种方法：一种是公园或厂区的集中供应，管道直接连接到使用点；另一种是从气瓶供应气体，气瓶设置在气瓶之间，通过汇流排放送至煤气使用点。"实验区公用管道的接入方式有两种：一种是直接将使用点从地板或地板下连接到使用点，另一种是将管道放置在公用夹层中，通过功能柱或隔墙连接到使用点。注意灭菌器(特别是电加热设备)等大功率设备的电源设计；精密仪器考虑稳压电源和UPS；考虑一些精密仪器的独立接地设计；考虑合理的网络、监测和插座设计等。
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