洁净实验室操作间的消毒方法及周期：每次使用前或个别沉淀细菌超标时，可使用紫外线照射30分钟"每六个月或当沉降菌严重不合格时，使用甲醛熏蒸。方法：计算消毒空间体积。甲醛35×38%溶液10 ml，高锰酸钾2g/m3。取适量高锰酸钾，用大约60℃的热水溶解，倒入定量甲醛溶液，用一层纱布盖住杯子，人员立即离开清洁区域，关上门窗16小时，关闭新鲜空气入口，开启空调循环2小时以上消毒空调，感觉无异味，人员用75%酒精擦拭所有物体(包括地面)表面。在一般使用过程中，当沉淀菌较差时，还可使用~1 mol/L乳酸m~3喷雾剂，熏蒸封口12小时以上，然后排风。
洁净实验室中，机械仪器设备洁净室和一般生物洁净室都是采用正压维持, 但对于使用有害气体或使用易燃易爆溶剂以及其他有特殊要求的洁净实验室则采用负压控制。 洁净实验室维持一定的正压是保证洁净室不受或少受污染、是维持设计洁净度等级必不可少地条件之一。即便是负压洁净室，它也必须有不低于它洁净度级别地相邻房间或套间维持一定的正压，负压洁净室的洁净度才能得以维持。 洁净室正压值是指门窗全部关闭状态下，室内静压大于室外静压的数值。它是通过净化系统送风量大于回风量和排风量的方法来达到。不同等级的洁净实验室以及实验室内洁净区与非洁净区之间的静压差，应不小于5Pa，洁净区与室外的静压差，应不小于10 Pa.。 此外，洁净实验室对于风量，风速等各项指标的技术要求也都非常严格，因此，空调系统必须能够满足对其参数进行精确的控制。
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